282: 嗅觉受体(Odorant Receptors)
稍微呼吸一下,感受一下你所闻到的一切。现在,我的办公室里有很多气味。一股酵母味表明细菌培养基正在走廊尽头的实验室里进行高压灭菌。从旧书上传来的明显气味表明我还没有完全迁移到数字媒体上,但一缕淡淡的灰尘表明我已经很久没有阅读这些书了。我桌子上的杯子整天都散发着令人愉快的香气,但在某些日子里,它又被一股强烈的咖啡味所取代。我们的嗅觉不断为我们提供关于周围环境的信息,为我们提供关于近处和远处正在发生什么的线索。许多气味是由一系列嗅觉受体(olfactory odorant receptor)识别的,这些受体监测我们呼吸的空气,告知我们附近有有趣的分子。
有气味的物质和受体
有气味的物质(odorant)通常是小分子,通过空气飘到鼻子里,其化学特性使它们能够进入粘膜(mucous membrane)并达到嗅觉受体。很难确定可能有气味的物质的数量,估计可能存在10000到400亿个不同的有气味的分子。对我们基因组的检查表明,我们的鼻子里大约有400种不同的嗅觉受体。这些受体由鼻子中的专门神经元监控,通常每个神经元中只包含一种类型的嗅觉受体。然而,正是这些组合使我们的嗅觉变得丰富。每种嗅觉受体通常与几种类似类型的气味分子结合,每种有气味的物质与几种不同类型的嗅觉受体结合。然后大脑对所有组合进行分类,并识别出特定的气味。
臭并不总是坏事
这里描述的嗅觉受体(PDB条目8f76)可以识别气味分子丙酸(propionate)。纯粹的丙酸盐有一种刺鼻的难闻气味。然而,瑞士奶酪生产商精心培养了一种能产生丙酸盐的特殊细菌,他们通过添加少量的丙酸盐来增加奶酪的诱人味道。这种受体还能识别乙酸(acetate),这是一种比丙酸略小的分子,使醋具有尖锐的气味。它是一个G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR),类似于光感应视紫红质(rhodopsin)或神经递质受体,如肾上腺素能受体(adrenergic receptor)和血清素受体(serotonin receptor)。与其他GPCRs一样,气味分子与受体上的特定细胞外位点结合,导致受体的形状发生变化。这被细胞内的G蛋白(G protein)感知,并最终刺激了神经细胞。
传递有气味的物质
许多动物也制造小的蛋白质来捕捉和传递气味分子到嗅觉受体。这里显示的是PDB条目1e00的结构,从猪身上获得。另一方面,昆虫会制造各种气味结合蛋白(odorant-binding protein,OBPs),帮助它们的触角和其他感觉器官捕捉气味物质,PDB档案揭示了一些气味物质结合蛋白的结构,这些蛋白被飞蛾用来寻找交配伙伴,被蚊子用来寻找人类进行叮咬。这里显示的就是这样一个结构,PDB条目3n7h。这里结合了驱蚊剂DEET,它通常会阻挡通道防止有气味的物质进入。请注意,哺乳动物和昆虫的蛋白质以完全不同的方式折叠。这提供了证据,证明它们分别进化出类似的功能。
探索结构
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从PDB条目8f76中可以看出,这个嗅觉受体的结合位点围绕着丙酸,利用特定的氨基酸来识别丙酸和类似的酸性小分子。丙酸的一端是一个带负电的酸性基团,所以受体利用带正电的精氨酸(arginine)来捕获它,谷氨酰胺(glutamine)和丝氨酸(serine)与丙酸建立稳定的氢键。丙酸的另一端含有两个疏水的碳原子,被受体中的一个小的疏水氨基酸口袋所包围。少了一个碳原子的乙酸很适合这个口袋,但比丙酸大的酸性分子不适合这里。点击图片下面的按钮,切换到交互式图片,可以看到这个结构的更多细节。
进一步的讨论议题
参考文献
- 8f76 2023 Structural basis of odorant recognition by a human odorant receptor. Nature 615 742-749
- 2022 Transport features predict if a molecule is odorous. Proc Natl Acad Sci USA 119 e2116576119
- 2022 Odorant-binding proteins of mammals. Biol Rev 97 20-44
- 3n7h 2012 Anopheles gambiae odorant binding protein crystal complex with the synthetic repellent DEET: implications for structure-based design of novel mosquito repellents. Cell Mol Life Sci 69 283-297
- 1e00 2000 Complexes of porcine odorant binding protein with odorant molecules belonging to different chemical classes. J Mol Biol 300 127-139