282: 嗅覺受體(Odorant Receptors)
稍微呼吸一下,感受一下你所聞到的一切。現在,我的辦公室裡有很多氣味。一股酵母味顯示細菌培養基正在走廊盡頭的實驗室裡進行高壓滅菌。從舊書上傳來的明顯氣味表明我還沒有完全遷移到數位媒體上,但一縷淡淡的灰塵表明我已經很久沒有閱讀這些書了。我桌上的杯子整天都散發著令人愉悅的香氣,但在某些日子裡,它又被一股強烈的咖啡味所取代。我們的嗅覺不斷為我們提供周圍環境的訊息,為我們提供關於近處和遠處正在發生什麼的線索。許多氣味是由一系列嗅覺受體(olfactory odorant receptor)識別的,這些受體監測我們呼吸的空氣,告知我們附近有有趣的分子。
有氣味的物質和受體
有氣味的物質(odorant)通常是小分子,透過空氣飄到鼻子裡,其化學特性使它們能夠進入黏膜(mucous membrane)並達到嗅覺受體。很難確定可能有氣味的物質的數量,估計可能存在10000到400億個不同的有氣味的分子。對我們基因組的檢查表明,我們的鼻子裡大約有400種不同的嗅覺受體。這些受體由鼻子中的專門神經元監控,通常每個神經元只包含一種類型的嗅覺受體。然而,正是這些組合使我們的嗅覺變得豐富。每種嗅覺受體通常與幾種類似類型的氣味分子結合,每種有氣味的物質與幾種不同類型的嗅覺受體結合。然後大腦對所有組合進行分類,並識別出特定的氣味。
臭味並不總是壞事
這裡描述的嗅覺受體(PDB條目8f76)可以辨識氣味分子丙酸(propionate)。純粹的丙酸鹽有一種刺鼻的難聞氣味。然而,瑞士起司生產商精心培養了一種能產生丙酸鹽的特殊細菌,他們透過添加少量的丙酸鹽來增加起司的誘人味道。這種受體還能辨識乙酸(acetate),這是一種比丙酸略小的分子,使醋具有尖銳的氣味。它是一個G蛋白偶聯受體(G protein-coupled receptor,GPCR),類似於光感應視紫紅質(rhodopsin)或神經傳導物質受體,如腎上腺素能受體( adrenergic receptor)和血清素受體(serotonin receptor)。與其他GPCRs一樣,氣味分子與受體上的特定細胞外位點結合,導致受體的形狀改變。這被細胞內的G蛋白(G protein)感知,並最終刺激了神經細胞。
傳遞有氣味的物質
許多動物也製造小的蛋白質來捕捉和傳遞氣味分子到嗅覺受體。這裡顯示的是PDB條目1e00的結構,從豬身上取得。另一方面,昆蟲會製造各種氣味結合蛋白(odorant-binding protein,OBPs),幫助它們的觸角和其他感覺器官捕捉氣味物質,PDB檔案揭示了一些氣味物質結合蛋白的結構,這些蛋白被飛蛾用來尋找交配夥伴,被蚊子用來尋找人類進行叮咬。這裡顯示的就是這樣一個結構,PDB條目3n7h。這裡結合了驅蚊劑DEET,它通常會阻擋通道防止有氣味的物質進入。請注意,哺乳動物和昆蟲的蛋白質以完全不同的方式折疊。這提供了證據,證明它們分別進化出類似的功能。
探索結構
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從PDB條目8f76可以看出,這個嗅覺受體的結合位點圍繞著丙酸,利用特定的胺基酸來辨識丙酸和類似的酸性小分子。丙酸的一端是一個帶負電的酸性基團,所以受體利用帶正電的精氨酸(arginine)來捕獲它,谷氨酰胺(glutamine)和絲氨酸(serine)與丙酸建立穩定的氫鍵。丙酸的另一端含有兩個疏水的碳原子,被受體中的一個小的疏水氨基酸口袋所包圍。少了一個碳原子的醋酸很適合這個口袋,但比丙酸大的酸性分子不適合這裡。點擊圖片下面的按鈕,切換到互動式圖片,可以看到這個結構的更多細節。
進一步的討論議題
參考文獻
- 8f76 2023 Structural basis of odorant recognition by a human odorant receptor. Nature 615 742-749
- 2022 Transport features predict if a molecule is odorous. Proc Natl Acad Sci USA 119 e2116576119
- 2022 Odorant-binding proteins of mammals. Biol Rev 97 20-44
- 3n7h 2012 Anopheles gambiae odorant binding protein crystal complex with the synthetic repellent DEET: implications for structure-based design of novel mosquito repellents. Cell Mol Life Sci 69 283-297
- 1e00 2000 Complexes of porcine odorant binding protein with odorant molecules belonging to different chemical classes. J Mol Biol 300 127-139