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'''ようこそMolmil wikiへ!'''
'''ようこそMolmil wikiへ!'''


==Introduction==
==はじめに==


'''Molmil''' is a new molecular viewer developed for a web environment with the intent to be usable on as many platforms as possible, while offering GPU hardware acceleration via OpenGL, offering stunning graphics and optimal performance. Not only do we integrate the molmil viewer into our existing services we offer like we do with jV, molmil is also available as a [https://pdbj.org/molmil/ standalone viewer]. Via the standalone viewer you can load your own PDB, PDBML PDBx/mmCIF, mmJSON files, but also load existing PDB entries (via PDB ID) and chem_comp entries (via chem_comp id). Finally it is also possible to load [https://pdbj.org/help/polygon-files polygon-xml files]. In the future we will add additional features and feature requests are of course also appreciated. It is also possible to integrate molmil on your [https://pdbj.org/help/integrate-molmil own website].
'''Molmil'''（もるみる）は[https://pdbj.org/ PDBj]の[https://github.com/gjbekker Gert-Jan Bekker]（ゲルトヤン・ベッカー）が開発した新しい分子閲覧ソフトです。
インターネットに接続されたウェブ環境で利用することを想定し、できるだけ多くの環境で利用できるように設計されています。OpenGLによるGPUハードウェアアクセラレーションを用い、美しいグラフィックスと最適なパフォーマンスを実現します。Molmilビューアは既存のサービスに組み込むだけではなく、[https://pdbj.org/jv/index_j.html jV]と同じように[https://pdbj.org/molmil/ スタンドアロンビューア]としても用いることができます。スタンドアロンビューアを使って、自身で作成したPDB、PDBML、mmCIF、mmJSONの各フォーマットファイルを読み込むことができるだけではなく、PDB IDやChem Comp IDを指定して既存の構造を読み込むこともできます。さらに、jV用[https://pdbj.org/help/polygon-files ポリゴンXMLファイル]も読み込むことができます。今後さらに機能を追加していきます。機能追加のリクエストもお待ちしています。また、Molmilを自分のウェブサイトに埋め込むこともできます。方法については[https://pdbj.org/help/integrate-molmil こちら]をご覧下さい。


==How to Use==
==使い方==
Please see the following pages for usage of Molmil.
Molmilの使い方については下記ページを参照下さい。
* [https://pdbj.org/help/molmil-manual Molmil User Manual]
* [https://pdbj.org/help/molmil-manual Molmilユーザーマニュアル]
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/Molmil-usage Molmil usage]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/Molmil-usage Molmilの基本的な使い方]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/Integrate-Molmil Integrate Molmil]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/Integrate-Molmil Molmilをウェブページに埋め込む方法]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/Molmil-API Molmil API]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/Molmil-API Molmilの詳細な使い方（Molmil APIの解説）]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/FAQ Molmil FAQ]（GitHub）
* [https://github.com/gjbekker/molmil/wiki/FAQ Molmil FAQ]（GitHub）


==Support==
==動作要件==
On desktops, laptops and workstations, to use molmil, it is recommended to install the latest version of your favourite browser. For some older versions of Safari and Opera it is also required to [http://www.khronos.org/webgl/wiki/Getting_a_WebGL_Implementation enable WebGL]. Finally make sure that your drivers are not too old (2010-12-31).


On mobile devices (smartphones/tablets), it is recommended to install the latest version of Chrome for Android, Firefox for Andriod, Opera Mobile or the Blackberry browser. iOS (iPhone/iPad) is currently supported from iOS 8.0. In case your browser supports WebGL, you will be able to see and use a preview of our new molmil viewer:
Molmilを利用する際、ご利用のブラウザを最新版に更新しておくことをお勧めします。 最新ではないSafariやOperaの中には、[http://www.khronos.org/webgl/wiki/Getting_a_WebGL_Implementation WebGL]を有効化する必要があるものもあります。 また、ドライバが古すぎない（2010年12月31日以前ではない）ことも確認して下さい。


==Trouble Shooting==
モバイル端末（スマートフォン、タブレット）のうちAndroid、Blackberry場合、Chrome、Firefox、Opera、Blackberryブラウザのいずれかで最新のものをお使い下さい。 iOS（iPhone、iPad）については、現在iOS 8.0は対応しています。
* [https://pdbj.org/help/faq_molmil01 Molmil viewer no longer works.]
<iframe key="pdbj" path="/molmildoc/src/sample1.html" width="650" height="450"/>
* [https://pdbj.org/help/faq_molmil02 The OS crashes when the Enable button on the Molmil page is clicked.]
 
* [https://pdbj.org/help/faq_molmil03 Links to Molmil viewer do not appear. / Molmil does not work.]
==トラブルシューティング==
* [https://pdbj.org/help/faq_molmil01 最近、Molmil viewerが動作しなくなりました。]
* [https://pdbj.org/help/faq_molmil02 MolmilページのEnableボタンをクリックするとOSがクラッシュします。]
* [https://pdbj.org/help/faq_molmil03 Molmil viewerへのリンクが表示されません。/ Molmilが動作しません。]

Latest revision as of 12:26, 10 January 2023

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ようこそMolmil wikiへ!

はじめに

Molmil（もるみる）はPDBjのGert-Jan Bekker（ゲルトヤン・ベッカー）が開発した新しい分子閲覧ソフトです。 インターネットに接続されたウェブ環境で利用することを想定し、できるだけ多くの環境で利用できるように設計されています。OpenGLによるGPUハードウェアアクセラレーションを用い、美しいグラフィックスと最適なパフォーマンスを実現します。Molmilビューアは既存のサービスに組み込むだけではなく、jVと同じようにスタンドアロンビューアとしても用いることができます。スタンドアロンビューアを使って、自身で作成したPDB、PDBML、mmCIF、mmJSONの各フォーマットファイルを読み込むことができるだけではなく、PDB IDやChem Comp IDを指定して既存の構造を読み込むこともできます。さらに、jV用ポリゴンXMLファイルも読み込むことができます。今後さらに機能を追加していきます。機能追加のリクエストもお待ちしています。また、Molmilを自分のウェブサイトに埋め込むこともできます。方法についてはこちらをご覧下さい。

使い方

Molmilの使い方については下記ページを参照下さい。

動作要件

Molmilを利用する際、ご利用のブラウザを最新版に更新しておくことをお勧めします。 最新ではないSafariやOperaの中には、WebGLを有効化する必要があるものもあります。 また、ドライバが古すぎない（2010年12月31日以前ではない）ことも確認して下さい。

モバイル端末（スマートフォン、タブレット）のうちAndroid、Blackberry場合、Chrome、Firefox、Opera、Blackberryブラウザのいずれかで最新のものをお使い下さい。 iOS（iPhone、iPad）については、現在iOS 8.0は対応しています。

トラブルシューティング

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