3C-likeプロテアーゼと阻害剤

(PDB ID:6lu7, 7n89, 7rfs, 7vu6)

これは3C-likeプロテアーゼというコロナウイルスの酵素タンパク質です。このように全く同じ二つの蛋白質からできています。コロナウイルスは、 ポリプロテイン1ab という7096アミノ酸からなる非常に長いタンパク質を、まず、合成させます。そのあと、その長いタンパク質を切断して、15個のタンパク質にします。そのとき、タンパク質を切断する酵素の一つが、この3C-likeプロテアーゼです。ここに結合している黄色のひも状の分子が、切断されるポリプロテイン1abの一部です。7096アミノ酸から8アミノ酸（3259-3266番目）だけを切り出したものです。この5番目（3263番目）と6番目（3264番目）のアミノ酸の間で切断されます。このタンパク質は、治療薬の標的として注目されています。 例えば、抗ウィルス剤パキロビッド(ニルマトレルビル)は、基質タンパク質が結合する場所に、じゃまをするように結合してしまいます。すると、タンパク質の切断ができなくなり、ウイルスが体内に広がることを止めることができます。 同じように 阻害剤ゾコーバ(エンシトレルビル)も、基質タンパク質の結合部位に結合し、タンパク質の切断をじゃますることができます。こうしたプロテアーゼの阻害剤は多くの製薬会社が開発を行っています。