BINDS-PDBj講習会「PDBから見てわかるタンパク質の最新研究」(2021/09/30)

Molmilを用いた立体構造のページ: 大澤 匡範 先生 (慶應大薬)

hERGの立体構造 (PDB ID:5va1-1)
APETx1の立体構造 (PDB ID:7bwi)
APETx1の変異体の設計
hERGのVSDドメインのS4-up, S4-downのモデルとAPETx1のドッキングモデル

参考文献

Matsumura K, Shimomura T, Kubo Y, Oka T, Kobayashi N, Imai S, Yanase N, Akimoto M, Fukuda M, Yokogawa M, Ikeda K, Kurita JI, Nishimura Y, Shimada I, Osawa M. Mechanism of hERG inhibition by gating-modifier toxin, APETx1, deduced by functional characterization. BMC Mol Cell Biol. 2021 Jan 7;22(1):3. doi: 10.1186/s12860-020-00337-3.